有機檢索理念

    為什么又要談檢索，不是因為我有什么新發現，而是我與一些檢索高手和新手交談后，發現了很多問題，如重復檢索，需要的時候卻檢索不到，只了解一些文獻數據庫，對其它數據庫卻不了解，密碼和代理資源嚴重枯竭……等等。因此感到很憂慮，于是有感而發寫的，希望大家能樹立新的檢索方式和理念，改變上述現狀。

    談到檢索，大家第一想法是查文獻，有人便認為是找數據庫，有人說是pubmed,都不完全對。檢索是一種舉動，從最初不懂到懂，這需要一個過程，但許多戰友檢索水平高了，會找密碼和代理了，便認為自己天下無敵了，其實不然，這不是真正的檢索高手，真正的檢索高手，應該是全方位地了解檢索，全方位地、高效地運用你的檢索技巧，正如以前一句話：檢索讓你的生活變得輕松起來！打個比方，為什么檢索水平越高，在檢索上花的時間反而越多？而且隨著你的檢索水平提高，你獲得文獻的速度并未成正比？因為我們都有一些不良的檢索習慣，因此今天我倡導的是一種新的檢索理念---"有機檢索"或叫"生物檢索".這也是我通過長期文獻檢索獲得的經驗和教訓，希望大家能此為起點，達到一個更高的高度，那么我的目的便達到了。

    為什么叫有機檢索或生物檢索呢？強調的是有計劃，有組織，協調檢索過程，使檢索變得簡單化，高效化，為工作和學習帶來更多的便捷。

    首先應該了解為什么要檢索，什么東西需要我檢索，在什么地方檢索？如何高效率地檢索到自己的所需？如何應對檢索不到的文獻和資料？檢索后應該怎么做？

    具體說一說，希望大家看完這里內容后，能反思一下，自己過去的檢索方式，能否需要進一步改進一下？

    1 檢索的第一步是為什么要檢索？檢索是工具，是學習和工作的工具，為更好的學習和工具提供指南，因此我這篇的名字也叫指南針，即源于此。

    2 什么東西需要檢索？大家多認為是文獻，paper.不完全正確，我們真正需要的東西，只有一部分是paper,更多的是其它的東西，這些東西同樣需要檢索！同樣值得重視。因此在檢索之前你就應該思考，我檢索什么東西。

    打個比方，我想作一個PPT,想找一個"cell"或一個mitochondria,那么你怎么找？至少有以下一些答案：（1）在google上找圖片，輸入關鍵cell,OK很好，找到很多你需要的，很方便。但眾所周知原因，google搜索到的圖片，很難打開很多。（2）輸入cell filetypePT,在google中找，找到專業的PPT作參考。OK,也是好方法之一。（3）去pubmed, sciencedirect,OVID上去找最新的paper,然后從paper中挑出好看的圖作參考。我想以上幾種方法都可以實現，但都不是理想的方案，你至少要花一定的時間，可以說你都不是很高效的檢索手段。因為有時會存在一時找不到合適的東東的現象，為此許多大蝦很迷茫，甚至說昨天我還找到了，怎么今天老找不著呢？搜呀搜，還是找不到！我想大蝦級人物經常會遇到這些情況，如果你有，表明你應該更改一下你的搜索理念了。

    3 在什么地方檢索？當然在數據庫。不，在數據庫，以及互聯網上其它一些地方。大蝦級人物可能不以為然，當然了，找全文，可以在數據庫中找，可以通過google搜索PDF文件，可以到作者的個人主頁上找，或所在研究單位去找，還可以用email去要，也可以去生物谷等網站去求助，還可以找圖書館館際互借……，但如何有機地處理這些方式，以達到最快找到你所需的東西？方法千萬種，但我們需要的是最快的一種！這便是有機檢索的精髓。

    如何達到有機，或高效率檢索？

    其一，在知識層面上要了解全球數據庫的概況，使檢索具有方向性和合理性。

    需要大家熟悉全球大的數據庫（不包括個人主頁等檢索方式了）,數據庫不僅是文獻數據庫，如OVID,sciencedirect, human press, blackwell, BP,ACS,CA,BA,還包括專業數據庫，如疾病數據庫，基因和蛋白質各種數據庫等等，這里列了較齊全的數據庫集合吧http://www.bioon.com/Article_Class.asp?ClassID=48, 只要找對合適的數據庫才能達到有效地檢索。如果大家都能對數據庫有個大概了解，我想，你的檢索水平已經足夠高了。當然，檢索內容還包括用google對圖像，PPT,PDF,等檢索（下一代檢索也許會用微軟的longhorn的新的檢索工具了）,因此要求大家對檢索知識有個初步的掌握，我想我們論壇中有足夠多的教程，尤其是入門教程供參考了。千萬不要忽視這些入門的東西，對檢索高手來說，常溫習這些知識同樣重要！因為這是檢索的基礎。

    其二，檢索不要貪多，一定要精，使檢索達到最簡化和最優化。尤其是檢索文獻，有人喜歡一次性下載一兩百篇文獻，所謂"通吃",最終看了多少？十有***是浪費！paper是用來讀的，不是用來收藏的。如何高效地檢索也包括這一點：只要必需的！不是必需的，不必找！同時看paper只看重要的paper,一般的，或比較差的paper最好少看，有時會誤導你的思路的。看時要做標記，并且進入你的數據庫，至少今后你會大概的印象，你讀過這些文獻沒有？另外，經常見到網上有人求助沒有電子版的文章，或一些偏僻的雜志的文章，我不說這些文章一定沒有價值，至少大部分時候，我們都可以將這些文章價值忽略！并不是自己必需要的東西，如果沒有也不必可惜和遺憾！多讀重要的，有創新的paper（大多網上有電子版）.同時也沒有必要每一篇都讀過去，只讀特別相關的，了解一些周邊的信息。文獻讀多了，會被文獻套牢了，你沒有思路了。相反，一篇好文獻，值得你反復回味，多讀數遍都可以，一直到讀懂，讀透為止。

    其三，要求一次檢索服務終生，使檢索效率達到最大化！這便是高效！許多朋友在需要時便檢索，檢索完畢，東東就沒了，或者不知道放到哪了，或者隨手扔了，下次需要時再檢索。但一定要知道，有時候當你需要的時候，它并不容易被你檢索到。如何避免這種情況呢，這便是我講的重點之一。

    建立自己的數據庫是達到有機檢索的重要方法之一，也是檢索后應該做的主要事情！personal database,或private database.將你所查過的有用信息（因為你現在查了，如果你學習和工作的方向不變，將來可能還會有用）,尤其是精華的，有用的信息，及時進行歸類整理，相信時間長了，自然便有了自己的小數據庫，如果要查什么內容，首先想到的是自己的數據庫，如果刻盤，可以隨身攜帶，多么方便快捷，即使不能上網的地方也可以用！其實我們只要細心，就會發現網上有許多試用數據庫和免費的內容，但過一段時間后便不免費了，那時再想查這方面文章，就來不急了，甚至你以前查到的內容現在沒有了，難道不可惜？如果建立數據庫后，便不存在煩惱了。

    如何建立自己的數據庫呢？我講一點我個人經驗供參考。可以在硬盤（不要在C盤）設立一個文件夾，可以進行分類（最好用英文名）,如image, protocol,PDF,Note等，然后分別建立下級文件夾，如在image中建立cell, DNA, human, animal, disease等，Protocol 中建立Immune, molecular biology, cellular biology, biochem…，以供實驗使用。這個看自己的專業需要而定。而PDF文件，我希望所有的求助者和應助者都應養成一個良好習慣！所有經過你手頭的文獻都要入庫！建議文件采用reference manage或endnote軟件進行管理，并進行適當地分類，按軟件的編號給你的文獻編上相應的序號（如1.pdf, 2.pdf, 3.pdf…）,并將文摘導入到軟件中（可以直接導入，如果不會用，可以去下載中心下載軟件說明書，很快便能學會）.錄入時每篇花個幾分鐘，這樣隨時間積累，你的數據庫將越來越大，這樣查找起來非常方便，只要知道關鍵詞或某個詞，便能發現不僅僅是一篇你需要的文章，而是很多，應助別人，幫助自己，都很方便。因此我個人希望我們生物谷的每個人都學會這種習慣，backup your finding.

    記得與oxworkerman 談到檢索習慣時，他說他每次檢索后，都將檢索的內容，以及這次檢索的經驗，或發現了什么好地方，都會做電子版的分類記錄，每次幾分鐘，定期整理一下，時間長了，水平提高了，自己歸類能力強了，工作有序了，檢索高效了！我想這非常值得大家借鑒和學習。好的檢索方式會大大提高你的和大家的工作效率。但如果能將檢索到的結果也都備份一下，建立自己的數據庫，這樣就更方便了！珍惜檢索到的文獻是很重要的品德。

    過去稱好記性不如爛筆頭，現在應該叫高水平不如簡化的電子筆記。

    當然，個人數據庫要有機安排。做電子記錄和備份，一定不要亂！事先規化好很重要，以后的改動只是作小的修改，不能事先眉毛胡子一把抓，后來自己也搞不清哪對哪了。

    講到檢索理念我不由自主想到檢索的密碼和代理問題，由于國內的經濟狀況，許多數據庫內容我們無法得到，這也是限制中國生命科學發展的重要瓶頸。因此找代理和密碼便變成了大家的焦點。本人作為個人并不反對你自已去找，但我想不應該把尋求代理和密碼與檢索等同起來！檢索是一門大學問，而代理和密碼只是技巧而已，如何掌握好檢索，這是生物谷和中國生命科學論壇的一個重要目標。有人統計過，在互聯網電子資源中，免費資源比重超過90%!對于我們面前的，收費的主要是許多期刊雜志，這些是我們需要的內容。其實有時我們只要看文摘就已足夠，因為大部分文章都沒有必要花大量時間去閱讀全文，而且還存在大量免費期刊，能掌握和了解這些免費期刊上的內容就基本上已滿足了大家的需要了，除非特殊情況，非要一些收費期刊不可。若能將檢索的好習慣運用起來，我想代理和密碼也會得到最高效地應用！也不會象現在一樣一個個死去了。